24/08/2016 16:00 Tartu Ülikool Fauna - EMÜ SK 4:6
01/09/2016 16:00 Tulevik Viljandi - JK Sillamäe Kalev 1:0 (0:0)
17:00 Saue JK Laagri - FC Infonet II 0:3 (0:1)
04/09/2016 10:00 JK Terav Sats - Raplamaa JK II 0:2 (0:0)
12:00 FC Kuressaare - Tallinna JK Legion 3:2
14:30 Rumori Calcio - JK Kernu Kadakas 4:3 (3:2)
06/09/2016 16:00 FC Tartu - FC Infonet 0:11 (0:4)
07/09/2016 15:30 JK Tallinna Kalev - SK Tääksi 5:0 (4:0)
20/09/2016 15:00 Rakvere JK Tarvas - Paide Linnameeskond 2:3 (0:1)
17:00 FCI Levadia III - JK Tammeka 1:8 (0:1)
21/09/2016 15:00 FC Molycorp Silmet - FC Flora III 6:5 (0:3, 4:4) aet
15:00 Kohtla-Järve JK Järve - FC Flora II 0:2 (0:0)
17:30 Narva United FC - Viimsi JK 3:2 (0:0, 0:0, 0:0) pso
27/09/2016 17:00 FC Levadia - Raasiku FC Joker 7:0 (3:0)
28/09/2016 17:00 FC Flora - Tõrva JK 5:0 (0:0)
05/10/2016 16:00 JK Nõmme Kalju - Pärnu JK Poseidon 10:0 (5:0)