1. Round 04/08/1999 SV Darmstadt 98 - Bayern München II 3:1 yellow-red card
2. Round 08/08/1999 Bayern München II - Wacker Burghausen 1:1 yellow-red card
3. Round 14/08/1999 Karlsruher SC II - Bayern München II 1:2
4. Round 20/08/1999 Bayern München II - TSV 1860 München II 1:3
5. Round 28/08/1999 FC Augsburg - Bayern München II 0:2 yellow card
6. Round 31/08/1999 Bayern München II - Borussia Fulda 7:1
8. Round 12/09/1999 Bayern München II - VfR Aalen 3:2 yellow card
9. Round 17/09/1999 SV Wehen-Taunusstein - Bayern München II 2:0
10. Round 27/09/1999 Bayern München II - SV Lohhof 4:2
11. Round 03/10/1999 TSF Ditzingen - Bayern München II 0:0 yellow card
13. Round 17/10/1999 Bayern München II - SSV Reutlingen 0:3 yellow card
14. Round 24/10/1999 VfB Stuttgart II - Bayern München II 3:0
15. Round 31/10/1999 Bayern München II - FSV Frankfurt 5:2
16. Round 06/11/1999 Quelle Fürth - Bayern München II 3:3
17. Round 14/11/1999 Bayern München II - SC Pfullendorf 1:0
20. Round 05/12/1999 Bayern München II - Karlsruher SC II 0:1
18. Round 11/12/1999 Bayern München II - SV Darmstadt 98 1:2 Goal yellow card
19. Round 01/03/2000 Wacker Burghausen - Bayern München II 2:0 yellow card
21. Round 05/03/2000 TSV 1860 München II - Bayern München II 4:3
23. Round 17/03/2000 Borussia Fulda - Bayern München II 1:0
24. Round 25/03/2000 Bayern München II - 1. FC Schweinfurt 05 2:0
26. Round 12/04/2000 Bayern München II - SV Wehen-Taunusstein 5:0
27. Round 16/04/2000 SV Lohhof - Bayern München II 1:3
25. Round 20/04/2000 VfR Aalen - Bayern München II 0:0
30. Round 06/05/2000 SSV Reutlingen - Bayern München II 3:1
31. Round 14/05/2000 Bayern München II - VfB Stuttgart II 1:6 red card
34. Round 27/05/2000 SC Pfullendorf - Bayern München II 0:1 yellow card