2. Round 22/08/1999 Bayer Leverkusen - Bayern München 2:0
3. Round 28/08/1999 Bayern München - SpVgg Unterhaching 1:0 Goal
4. Round 11/09/1999 MSV Duisburg - Bayern München 1:2
6. Round 24/09/1999 Bayern München - VfB Stuttgart 0:1
7. Round 02/10/1999 FC Schalke 04 - Bayern München 1:1
9. Round 23/10/1999 1. FC Kaiserslautern - Bayern München 0:2 Goal
10. Round 30/10/1999 Bayern München - VfL Wolfsburg 5:0 Goal
11. Round 06/11/1999 SSV Ulm 1846 - Bayern München 0:1
13. Round 27/11/1999 TSV 1860 München - Bayern München 1:0
14. Round 04/12/1999 Bayern München - Borussia Dortmund 1:1
15. Round 11/12/1999 Hansa Rostock - Bayern München 0:3 Goal
16. Round 14/12/1999 Bayern München - Arminia Bielefeld 2:1
17. Round 17/12/1999 Werder Bremen - Bayern München 0:2
18. Round 06/02/2000 Hamburger SV - Bayern München 0:0
20. Round 12/02/2000 SpVgg Unterhaching - Bayern München 0:2
22. Round 26/02/2000 Bayern München - Eintracht Frankfurt 4:1
23. Round 04/03/2000 VfB Stuttgart - Bayern München 2:0
24. Round 11/03/2000 Bayern München - FC Schalke 04 4:1 Goal
25. Round 18/03/2000 Hertha BSC - Bayern München 1:1
26. Round 25/03/2000 Bayern München - 1. FC Kaiserslautern 2:2
27. Round 01/04/2000 VfL Wolfsburg - Bayern München 1:1
28. Round 08/04/2000 Bayern München - SSV Ulm 1846 4:0
29. Round 12/04/2000 SC Freiburg - Bayern München 1:2
30. Round 15/04/2000 Bayern München - TSV 1860 München 1:2
31. Round 23/04/2000 Borussia Dortmund - Bayern München 0:1
32. Round 29/04/2000 Bayern München - Hansa Rostock 4:1
33. Round 13/05/2000 Arminia Bielefeld - Bayern München 0:3
34. Round 20/05/2000 Bayern München - Werder Bremen 3:1