4. Round 11/09/1999 MSV Duisburg - Bayern München 1:2
5. Round 18/09/1999 Eintracht Frankfurt - Bayern München 1:2
7. Round 02/10/1999 FC Schalke 04 - Bayern München 1:1
8. Round 16/10/1999 Bayern München - Hertha BSC 3:1
9. Round 23/10/1999 1. FC Kaiserslautern - Bayern München 0:2
10. Round 30/10/1999 Bayern München - VfL Wolfsburg 5:0
11. Round 06/11/1999 SSV Ulm 1846 - Bayern München 0:1
12. Round 20/11/1999 Bayern München - SC Freiburg 6:1
13. Round 27/11/1999 TSV 1860 München - Bayern München 1:0
14. Round 04/12/1999 Bayern München - Borussia Dortmund 1:1
15. Round 11/12/1999 Hansa Rostock - Bayern München 0:3 yellow card
16. Round 14/12/1999 Bayern München - Arminia Bielefeld 2:1
19. Round 09/02/2000 Bayern München - Bayer Leverkusen 4:1
20. Round 12/02/2000 SpVgg Unterhaching - Bayern München 0:2
21. Round 19/02/2000 Bayern München - MSV Duisburg 4:1
22. Round 26/02/2000 Bayern München - Eintracht Frankfurt 4:1
24. Round 11/03/2000 Bayern München - FC Schalke 04 4:1
25. Round 18/03/2000 Hertha BSC - Bayern München 1:1
26. Round 25/03/2000 Bayern München - 1. FC Kaiserslautern 2:2 yellow card
27. Round 01/04/2000 VfL Wolfsburg - Bayern München 1:1 yellow card
28. Round 08/04/2000 Bayern München - SSV Ulm 1846 4:0 yellow card
29. Round 12/04/2000 SC Freiburg - Bayern München 1:2
30. Round 15/04/2000 Bayern München - TSV 1860 München 1:2
31. Round 23/04/2000 Borussia Dortmund - Bayern München 0:1 yellow card
33. Round 13/05/2000 Arminia Bielefeld - Bayern München 0:3
34. Round 20/05/2000 Bayern München - Werder Bremen 3:1