1. Round | 05/03/2016 | FC Levadia | - | FC Flora | 0:0 | ||||
3. Round | 12/03/2016 | FC Flora | - | JK Narva Trans | 3:0 | ||||
4. Round | 19/03/2016 | JK Nõmme Kalju | - | FC Flora | 2:0 | ||||
5. Round | 01/04/2016 | FC Infonet | - | FC Flora | 1:1 | ||||
6. Round | 04/04/2016 | FC Flora | - | JK Tammeka | 0:0 | ||||
7. Round | 08/04/2016 | FC Flora | - | JK Sillamäe Kalev | 0:0 | ||||
8. Round | 16/04/2016 | Paide Linnameeskond | - | FC Flora | 1:1 | ||||
9. Round | 22/04/2016 | Pärnu Linnameeskond | - | FC Flora | 0:3 | ||||
17. Round | 26/04/2016 | FC Flora | - | FC Levadia | 1:2 | ||||
10. Round | 29/04/2016 | FC Flora | - | Pärnu Linnameeskond | 6:0 | ||||
11. Round | 06/05/2016 | FC Flora | - | Paide Linnameeskond | 2:0 | ||||
15. Round | 10/05/2016 | FC Flora | - | JK Nõmme Kalju | 0:0 | ||||
12. Round | 13/05/2016 | JK Sillamäe Kalev | - | FC Flora | 2:4 | ||||
13. Round | 16/05/2016 | FC Flora | - | JK Tammeka | 0:0 | ||||
14. Round | 24/05/2016 | JK Narva Trans | - | FC Flora | 1:2 | ||||
16. Round | 19/06/2016 | Rakvere JK Tarvas | - | FC Flora | 0:5 | ||||
18. Round | 10/07/2016 | FC Infonet | - | FC Flora | 4:3 |