| Period | Manager | Country | born |
| 12/09/2023 - 31/12/2024 | Oscar Ibáñez |
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08/08/1967 |
| 22/05/2023 - 11/09/2023 | Gerardo Ameli |
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18/09/1970 |
| 20/05/2023 - 21/05/2023 | Alessandro Morán |
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30/11/1972 |
| 10/12/2022 - 19/05/2023 | Leonel Álvarez |
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29/07/1965 |
| 21/10/2022 - 01/11/2022 | Jesús Cisneros |
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18/03/1978 |
| 03/07/2022 - 20/10/2022 | César Vigevani |
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30/08/1974 |
| 17/08/2021 - 02/07/2022 | Gerardo Ameli |
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18/09/1970 |
| 25/05/2021 - 15/08/2021 | Víctor Rivera |
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10/11/1968 |
| 18/06/2019 - 24/05/2021 | Marcelo Grioni |
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27/07/1966 |
| 01/01/2019 - 17/06/2019 | Duilio Cisneros |
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28/10/1971 |
| 18/05/2016 - 31/12/2016 | Oscar Ibáñez |
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08/08/1967 |
| 05/10/2015 - 31/12/2015 | Orlando Maltese |
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01/01/1973 |
| 02/10/2015 - 05/10/2015 | Sergio Ibarra |
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11/01/1973 |
| 01/01/2015 - 01/10/2015 | Jorge Espejo |
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20/08/1976 |
| 01/01/2013 - 31/12/2014 | Mario Viera |
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19/10/1959 |
| 17/04/2012 - 31/12/2012 | Raúl Arias |
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29/10/1957 |
| 29/08/2011 - 17/04/2012 | Carlos Jurado |
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11/06/1947 |
| 18/01/2011 - 28/08/2011 | Marcelo Trobbiani |
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17/02/1955 |
| 01/01/2010 - 31/12/2010 | Édgar Ospina |
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12/01/1956 |
| 20/04/2009 - 30/09/2009 | Marcelo Trobbiani |
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17/02/1955 |
| 01/01/2008 - 31/12/2008 | Franco Navarro |
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10/11/1961 |
| 17/03/2007 - 31/12/2007 | José Basualdo |
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20/06/1963 |
| 01/01/2007 - 06/03/2007 | Julio César Uribe |
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09/05/1958 |
| 06/01/2005 - 12/02/2005 | Carlos Sevilla |
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26/08/1950 |
| 01/01/2003 - 31/12/2004 | Freddy Ternero |
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26/03/1962 |
| 01/01/2002 - 30/06/2002 | Carlos Jurado |
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11/06/1947 |
| 01/01/2000 - 31/12/2001 | Freddy Ternero |
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26/03/1962 |
| 01/01/1994 - 30/06/1995 | Freddy Ternero |
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26/03/1962 |
![Cienciano [U20]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/48998.gif?fallback=png "Cienciano [U20]"){kind=small}