1. Round | 17/08/2016 | Universidad Catolica | - | Independiente Medellín | 0:1 | ||||
2. Round | 25/08/2016 | Independiente Medellín | - | Sportivo Luqueño | 3:0 | ||||
2. Round | 16/09/2016 | Sportivo Luqueño | - | Independiente Medellín | 2:0 | ||||
Quarter-finals | 26/10/2016 | Cerro Porteño | - | Independiente Medellín | 2:0 |