1. Round 02/08/1998 Preußen Münster - SC Verl 2:1
2. Round 08/08/1998 SV 07 Elversberg - Preußen Münster 1:1
5. Round 29/08/1998 Wuppertaler SV - Preußen Münster 2:1
6. Round 06/09/1998 Preußen Münster - LR Ahlen 1:1
7. Round 12/09/1998 Eintracht Trier - Preußen Münster 3:1
9. Round 27/09/1998 1. FC Saarbrücken - Preußen Münster 1:1
10. Round 02/10/1998 Preußen Münster - 1. FC Kaiserslautern II 1:1
11. Round 10/10/1998 SC Paderborn 07 - Preußen Münster 1:3 Goal
12. Round 18/10/1998 Preußen Münster - Sportfreunde Siegen 1:0
13. Round 25/10/1998 FC Remscheid - Preußen Münster 0:7
16. Round 15/11/1998 Preußen Münster - FC 08 Homburg 1:0
14. Round 21/11/1998 Preußen Münster - Alemannia Aachen 1:1
17. Round 29/11/1998 Bayer Leverkusen II - Preußen Münster 1:1
15. Round 16/12/1998 FSV Salmrohr - Preußen Münster 0:1
23. Round 07/03/1999 LR Ahlen - Preußen Münster 1:1
19. Round 11/03/1999 Preußen Münster - SV 07 Elversberg 3:0
24. Round 14/03/1999 Preußen Münster - Eintracht Trier 1:3
25. Round 21/03/1999 Borussia Dortmund II - Preußen Münster 3:2
26. Round 28/03/1999 Preußen Münster - 1. FC Saarbrücken 1:2 yellow card
18. Round 01/04/1999 SC Verl - Preußen Münster 0:2 yellow card
30. Round 01/04/1999 Preußen Münster - FC Remscheid 3:1
27. Round 11/04/1999 1. FC Kaiserslautern II - Preußen Münster 0:1
28. Round 18/04/1999 Preußen Münster - SC Paderborn 07 1:1 yellow card
29. Round 25/04/1999 Sportfreunde Siegen - Preußen Münster 1:1
21. Round 28/04/1999 SpVgg Erkenschwick - Preußen Münster 0:3
31. Round 07/05/1999 Alemannia Aachen - Preußen Münster 1:0
32. Round 16/05/1999 Preußen Münster - FSV Salmrohr 2:4
33. Round 23/05/1999 FC 08 Homburg - Preußen Münster 0:6
34. Round 30/05/1999 Preußen Münster - Bayer Leverkusen II 2:2