1. Round 01/08/1999 Sportfreunde Siegen - Borussia Dortmund II 1:0
2. Round 08/08/1999 Borussia Dortmund II - 1. FC Kaiserslautern II 3:0
4. Round 15/08/1999 Borussia Dortmund II - LR Ahlen 1:3
5. Round 22/08/1999 Eintracht Trier - Borussia Dortmund II 4:2 Goal
6. Round 29/08/1999 Borussia Dortmund II - SC Paderborn 07 3:0
7. Round 05/09/1999 SV 07 Elversberg - Borussia Dortmund II 0:1
8. Round 12/09/1999 Borussia Dortmund II - FK Pirmasens 0:0
9. Round 18/09/1999 Borussia Dortmund II - VfL Bochum II 1:5
10. Round 06/10/1999 Fortuna Düsseldorf - Borussia Dortmund II 2:2
13. Round 16/10/1999 Borussia Dortmund II - SC Verl 1:1
14. Round 24/10/1999 Preußen Münster - Borussia Dortmund II 3:4 GoalGoalGoal
15. Round 31/10/1999 Borussia Dortmund II - Bayer Leverkusen II 0:0
16. Round 07/11/1999 SC 07 Idar-Oberstein - Borussia Dortmund II 1:1
17. Round 14/11/1999 Borussia Dortmund II - Rot-Weiss Essen 1:1 yellow card
18. Round 28/11/1999 1. FC Saarbrücken - Borussia Dortmund II 5:0
19. Round 05/12/1999 Borussia Dortmund II - SG Wattenscheid 09 0:1
20. Round 14/12/1999 Borussia Dortmund II - Sportfreunde Siegen 2:2 GoalGoal
23. Round 13/02/2000 LR Ahlen - Borussia Dortmund II 1:0
24. Round 20/02/2000 Borussia Dortmund II - Eintracht Trier 3:0
25. Round 26/02/2000 SC Paderborn 07 - Borussia Dortmund II 0:2 Goal
30. Round 02/04/2000 KFC Uerdingen 05 - Borussia Dortmund II 1:1
32. Round 16/04/2000 SC Verl - Borussia Dortmund II 0:0
26. Round 20/04/2000 Borussia Dortmund II - SV 07 Elversberg 0:0
33. Round 24/04/2000 Borussia Dortmund II - Preußen Münster 1:0 yellow card
34. Round 30/04/2000 Bayer Leverkusen II - Borussia Dortmund II 0:0
35. Round 07/05/2000 Borussia Dortmund II - SC 07 Idar-Oberstein 1:2 yellow card
36. Round 13/05/2000 Rot-Weiss Essen - Borussia Dortmund II 2:0
37. Round 21/05/2000 Borussia Dortmund II - 1. FC Saarbrücken 0:0
38. Round 28/05/2000 SG Wattenscheid 09 - Borussia Dortmund II 0:0