2. Round | 09/08/2006 | Holstein Kiel | - | 1. FC Magdeburg | 5:0 | ||||
3. Round | 12/08/2006 | 1. FC Magdeburg | - | Bor. Mönchengladbach II | 3:0 | ||||
4. Round | 19/08/2006 | Rot Weiss Ahlen | - | 1. FC Magdeburg | 2:1 | ||||
6. Round | 02/09/2006 | Fortuna Düsseldorf | - | 1. FC Magdeburg | 3:1 | ||||
7. Round | 13/09/2006 | 1. FC Magdeburg | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:0 | ||||
8. Round | 16/09/2006 | Dynamo Dresden | - | 1. FC Magdeburg | 2:1 | ||||
10. Round | 30/09/2006 | 1. FC Magdeburg | - | Wuppertaler SV | 1:0 | ||||
11. Round | 14/10/2006 | Borussia Dortmund II | - | 1. FC Magdeburg | 1:3 | ||||
12. Round | 21/10/2006 | 1. FC Magdeburg | - | VfB Lübeck | 0:2 | ||||
13. Round | 28/10/2006 | Werder Bremen II | - | 1. FC Magdeburg | 2:2 | ||||
14. Round | 04/11/2006 | 1. FC Magdeburg | - | Hertha BSC II | 2:0 | ||||
16. Round | 11/11/2006 | 1. FC Magdeburg | - | SV Wilhelmshaven | 3:0 | ||||
17. Round | 18/11/2006 | Bayer Leverkusen II | - | 1. FC Magdeburg | 1:1 | ||||
18. Round | 25/11/2006 | 1. FC Magdeburg | - | Kickers Emden | 1:1 | ||||
19. Round | 02/12/2006 | FC St. Pauli | - | 1. FC Magdeburg | 2:0 | ||||
20. Round | 07/12/2006 | Hamburger SV II | - | 1. FC Magdeburg | 1:1 | ||||
38. Round | 02/06/2007 | 1. FC Magdeburg | - | FC St. Pauli | 1:1 |