Bundesliga Nord/Nordost   M. W D L goals
  at home 12 3 2 7 20 : 26
  Away 12 2 2 8 16 : 31
  24 5 4 15 36 : 57
DFB-Pokal   M. W D L goals
  at home 2 0 0 2 1 : 9
  2 0 0 2 1 : 9
overall   M. W D L goals
  at home 14 3 2 9 21 : 35
  Away 12 2 2 8 16 : 31
  Neutral Place 0 0 0 0 0 : 0
  26 5 4 17 37 : 66
Bundesliga Nord/Nordost
2023/2024 12. Round FC Carl Zeiss Jena - Werder Bremen 5:0 (3:0)
2021/2022 10. Round Werder Bremen - FC Carl Zeiss Jena 3:2 (2:0)
2018/2019 19. Round FC Carl Zeiss Jena - Werder Bremen 1:7 (0:3)
2018/2019 6. Round Werder Bremen - FC Carl Zeiss Jena 2:0 (1:0)
2016/2017 25. Round FC Carl Zeiss Jena - Werder Bremen 0:0 (0:0)
2016/2017 12. Round Werder Bremen - FC Carl Zeiss Jena 1:1 (1:0)
2015/2016 19. Round Werder Bremen - FC Carl Zeiss Jena 1:1 (1:1)
2015/2016 6. Round FC Carl Zeiss Jena - Werder Bremen 1:2 (1:1)
2014/2015 16. Round Werder Bremen - FC Carl Zeiss Jena 1:0 (0:0)
2014/2015 3. Round FC Carl Zeiss Jena - Werder Bremen 1:3 (0:1)
2013/2014 14. Round Werder Bremen - FC Carl Zeiss Jena 4:2 (3:0)
2013/2014 1. Round FC Carl Zeiss Jena - Werder Bremen 1:2 (0:1)
2012/2013 21. Round FC Carl Zeiss Jena - Werder Bremen 2:1 (1:1)
2012/2013 8. Round Werder Bremen - FC Carl Zeiss Jena 5:2 (3:0)
2009/2010 15. Round FC Carl Zeiss Jena - Werder Bremen 1:2 (1:1)
2009/2010 2. Round Werder Bremen - FC Carl Zeiss Jena 5:0 (2:0)
2008/2009 26. Round FC Carl Zeiss Jena - Werder Bremen 1:2 (0:1)
2008/2009 13. Round Werder Bremen - FC Carl Zeiss Jena 2:3 (1:2)
2007/2008 17. Round Werder Bremen - FC Carl Zeiss Jena 1:4 (0:1)
2007/2008 4. Round FC Carl Zeiss Jena - Werder Bremen 2:2 (2:2)
2004/2005 23. Round FC Carl Zeiss Jena - Werder Bremen 2:3 (0:1)
2004/2005 10. Round Werder Bremen - FC Carl Zeiss Jena 2:0 (0:0)
2003/2004 15. Round FC Carl Zeiss Jena - Werder Bremen 3:2 (2:2)
2003/2004 2. Round Werder Bremen - FC Carl Zeiss Jena 4:1 (3:0)
DFB-Pokal
2010/2011 Quarter-finals FC Carl Zeiss Jena - Werder Bremen 1:6 (0:4)
2003/2004 Quarter-finals FC Carl Zeiss Jena - Werder Bremen 0:3

For games that were decided on penalties the score after 120 minutes will be included in the ranking