| Squad | Appearances | ||
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| Name |  |
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| Hamit Altintop | 448' | 6 | 5 | 1 | 2 | 1 | 1 | - | - |
| Bordon | 540' | 6 | 6 | - | - | - | 1 | - | - |
| Levan Kobiashvili | 538' | 6 | 6 | - | 1 | 3 | 3 | - | - |
| Mladen Krstajić | 535' | 6 | 6 | - | 1 | - | 1 | - | - |
| Kevin Kurányi | 465' | 6 | 5 | 1 | 4 | 2 | - | - | - |
| Lincoln | 540' | 6 | 6 | - | - | 3 | - | - | - |
| Christian Poulsen | 535' | 6 | 6 | - | 1 | 1 | 1 | - | - |
| Frank Rost | 540' | 6 | 6 | - | - | - | - | - | - |
| Ebbe Sand | 173' | 6 | 2 | 4 | 2 | 1 | - | - | - |
| Fabian Ernst | 357' | 5 | 5 | - | 4 | - | 1 | - | - |
| Rafinha | 450' | 5 | 5 | - | - | - | 3 | - | - |
| Dario Rodríguez | 450' | 5 | 5 | - | - | - | 2 | - | - |
| Zlatan Bajramović | 11' | 4 | - | 4 | - | - | - | - | - |
| Søren Larsen | 204' | 4 | 2 | 2 | - | 1 | - | - | - |
| Gustavo Varela | 94' | 3 | 1 | 2 | 1 | - | - | - | - |
| Gerald Asamoah | 62' | 2 | - | 2 | - | - | 1 | - | - |
| Sebastian Boenisch | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Simon Cziommer | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Christofer Heimeroth | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Thomas Kläsener | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Joseph Laumann | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Tomasz Wałdoch | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Mimoun Azaouagh | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Bilal Aziz | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Alexander Baumjohann | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Niko Bungert | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Ralf Fährmann | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Tim Hoogland | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Mario Klinger | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Manuel Neuer | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Christian Pander | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Marco van Hoogdalem | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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