| 2. Round | 11/07/2016 | Deportes Tolima | - | Deportivo Cali | 1:0 |  |
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| 4. Round | 16/07/2016 | Fortaleza FC | - | Deportivo Cali | 0:2 | |
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| 5. Round | 24/07/2016 | Atlético Huila | - | Deportivo Cali | 2:1 | ||||
| 6. Round | 31/07/2016 | Deportivo Cali | - | Atlético Nacional | 1:0 | |
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| 7. Round | 07/08/2016 | Deportivo Cali | - | Independiente Medellín | 1:2 | ||||
| 8. Round | 14/08/2016 | Once Caldas | - | Deportivo Cali | 2:0 | ||||
| 13. Round | 18/08/2016 | Millonarios | - | Deportivo Cali | 1:0 | ||||
| 9. Round | 22/08/2016 | Deportivo Cali | - | Patriotas FC | 1:0 | ||||
| 10. Round | 27/08/2016 | Cortuluá | - | Deportivo Cali | 1:1 | |
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| 11. Round | 11/09/2016 | Deportivo Cali | - | Boyacá Chicó | 2:0 | |
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| 14. Round | 25/09/2016 | Deportivo Cali | - | Deportivo Pasto | 1:1 | ||||
| 16. Round | 17/10/2016 | Alianza Petrolera | - | Deportivo Cali | 1:0 | ||||
| 18. Round | 30/10/2016 | Jaguares de Córdoba | - | Deportivo Cali | 0:1 | ||||
| 19. Round | 05/11/2016 | Deportivo Cali | - | Envigado FC | 1:0 | |
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| 20. Round | 20/11/2016 | Águilas Doradas | - | Deportivo Cali | 1:3 |
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