| 2. Round | 05/02/2012 | Independiente Medellín | - | Envigado FC | 2:2 |  |
|||
| 3. Round | 11/02/2012 | Patriotas FC | - | Independiente Medellín | 2:1 | ||||
| 4. Round | 19/02/2012 | Independiente Medellín | - | Santa Fe | 1:1 | ||||
| 5. Round | 25/02/2012 | Atlético Huila | - | Independiente Medellín | 1:0 | ||||
| 6. Round | 04/03/2012 | Independiente Medellín | - | La Equidad | 0:1 | ||||
| 7. Round | 11/03/2012 | Atlético Nacional | - | Independiente Medellín | 1:2 | ||||
| 9. Round | 26/03/2012 | Independiente Medellín | - | Atlético Nacional | 1:0 | ||||
| 10. Round | 31/03/2012 | Real Cartagena | - | Independiente Medellín | 3:2 | ||||
| 11. Round | 09/04/2012 | Independiente Medellín | - | Deportivo Cali | 0:1 | ||||
| 12. Round | 14/04/2012 | Itagüi Ditaires | - | Independiente Medellín | 1:1 | ||||
| 13. Round | 22/04/2012 | Independiente Medellín | - | Boyacá Chicó | 0:3 | ||||
| 14. Round | 29/04/2012 | Millonarios | - | Independiente Medellín | 2:1 | ||||
| 15. Round | 06/05/2012 | Independiente Medellín | - | Deportes Tolima | 0:1 | ||||
| 16. Round | 13/05/2012 | Cúcuta Deportivo | - | Independiente Medellín | 1:2 | |
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| 17. Round | 21/05/2012 | Atlético Junior | - | Independiente Medellín | 1:0 |
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