| 3. Round | 26/07/2009 | Deportivo Pasto | - | La Equidad | 1:1 | ||||
| 4. Round | 03/08/2009 | América de Cali | - | Deportivo Pasto | 1:1 | ||||
| 5. Round | 09/08/2009 | Deportivo Pasto | - | Atlético Junior | 1:0 |  |
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| 6. Round | 16/08/2009 | Deportes Quindío | - | Deportivo Pasto | 2:1 | |
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| 7. Round | 23/08/2009 | Deportivo Pasto | - | Deportes Tolima | 3:1 | ||||
| 8. Round | 30/08/2009 | Millonarios | - | Deportivo Pasto | 1:2 | ||||
| 9. Round | 13/09/2009 | La Equidad | - | Deportivo Pasto | 1:1 | ||||
| 10. Round | 20/09/2009 | Deportivo Pasto | - | Cúcuta Deportivo | 1:0 | |
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| 11. Round | 27/09/2009 | Atlético Nacional | - | Deportivo Pasto | 1:1 | |
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| 12. Round | 04/10/2009 | Deportivo Pasto | - | Once Caldas | 5:1 | ||||
| 13. Round | 17/10/2009 | Deportivo Pasto | - | Atlético Huila | 1:1 | ||||
| 14. Round | 22/10/2009 | Deportivo Cali | - | Deportivo Pasto | 3:0 | ||||
| 15. Round | 25/10/2009 | Deportivo Pasto | - | Real Cartagena | 1:0 | ||||
| 16. Round | 01/11/2009 | Boyacá Chicó | - | Deportivo Pasto | 1:0 | |
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| 18. Round | 15/11/2009 | Envigado FC | - | Deportivo Pasto | 3:4 |
Colombia