| 3. Round | 09/02/2025 | Envigado FC | - | Independiente Medellín | 0:1 | ||||
| 4. Round | 12/02/2025 | Independiente Medellín | - | Unión Magdalena | 1:1 | ||||
| 5. Round | 16/02/2025 | Millonarios | - | Independiente Medellín | 0:1 | ||||
| 8. Round | 09/03/2025 | La Equidad | - | Independiente Medellín | 0:0 | ||||
| 10. Round | 23/03/2025 | Atlético Nacional | - | Independiente Medellín | 1:1 | ||||
| 11. Round | 30/03/2025 | Independiente Medellín | - | Águilas Doradas | 0:0 | ||||
| 12. Round | 07/04/2025 | Atlético Junior | - | Independiente Medellín | 1:0 | ||||
| 14. Round | 15/04/2025 | Santa Fe | - | Independiente Medellín | 1:2 |  |
|||
| 15. Round | 20/04/2025 | Independiente Medellín | - | Once Caldas | 2:0 |  |
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| 16. Round | 27/04/2025 | Fortaleza FC | - | Independiente Medellín | 0:0 | ||||
| 17. Round | 04/05/2025 | Independiente Medellín | - | Atlético Nacional | 1:1 | ||||
| 18. Round | 10/05/2025 | Atlético Bucaramanga | - | Independiente Medellín | 2:0 |
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