| 2. Round | 02/02/2025 | La Equidad | - | Atlético Nacional | 0:1 |  |
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| 3. Round | 10/02/2025 | Atlético Nacional | - | Deportivo Pereira | 3:0 |  |
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| 4. Round | 13/02/2025 | Santa Fe | - | Atlético Nacional | 2:2 | ||||
| 6. Round | 23/02/2025 | Alianza FC | - | Atlético Nacional | 3:2 | |
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| 7. Round | 05/03/2025 | Fortaleza FC | - | Atlético Nacional | 1:5 | ||||
| 8. Round | 10/03/2025 | Atlético Nacional | - | América de Cali | 1:0 | |
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| 9. Round | 15/03/2025 | Envigado FC | - | Atlético Nacional | 0:0 | ||||
| 5. Round | 20/03/2025 | Atlético Nacional | - | Deportes Tolima | 4:3 | |
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| 10. Round | 23/03/2025 | Atlético Nacional | - | Independiente Medellín | 1:1 |  |
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| 13. Round | 14/04/2025 | Millonarios | - | Atlético Nacional | 0:0 | ||||
| 14. Round | 17/04/2025 | Atlético Nacional | - | Boyacá Chicó | 4:1 | |
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| 15. Round | 21/04/2025 | Deportivo Cali | - | Atlético Nacional | 1:0 | ||||
| 16. Round | 30/04/2025 | Atlético Nacional | - | Deportivo Pasto | 3:0 | ||||
| 17. Round | 04/05/2025 | Independiente Medellín | - | Atlético Nacional | 1:1 | ||||
| 18. Round | 12/05/2025 | Atlético Nacional | - | Llaneros FC | 2:1 | |
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| 19. Round | 18/05/2025 | Águilas Doradas | - | Atlético Nacional | 2:1 | |
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