| 2. Round | 08/02/2016 | Santa Fe | - | Millonarios | 0:0 | ||||
| 3. Round | 13/02/2016 | Millonarios | - | Deportivo Pasto | 1:1 | ||||
| 4. Round | 19/02/2016 | Alianza Petrolera | - | Millonarios | 0:2 |  |
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| 5. Round | 21/02/2016 | Millonarios | - | Jaguares de Córdoba | 2:0 |  |
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| 6. Round | 24/02/2016 | Águilas Doradas | - | Millonarios | 2:1 | ||||
| 7. Round | 28/02/2016 | Millonarios | - | Deportes Tolima | 2:1 | |
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| 8. Round | 06/03/2016 | Fortaleza FC | - | Millonarios | 2:0 | ||||
| 11. Round | 03/04/2016 | Once Caldas | - | Millonarios | 0:1 | ||||
| 16. Round | 30/04/2016 | Envigado FC | - | Millonarios | 2:0 | ||||
| 17. Round | 08/05/2016 | Millonarios | - | Cortuluá | 1:2 | ||||
| 18. Round | 15/05/2016 | La Equidad | - | Millonarios | 0:3 | |
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| 19. Round | 22/05/2016 | Millonarios | - | Atlético Huila | 2:1 | ||||
| 20. Round | 29/05/2016 | Independiente Medellín | - | Millonarios | 1:0 | |
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