| 12. Round | 24/10/2009 | NK Istra 1961 | - | HNK Šibenik | 1:2 | ||||
| 16. Round | 28/11/2009 | HNK Šibenik | - | NK Croatia Sesvete | 2:0 | ||||
| 17. Round | 05/12/2009 | NK Osijek | - | HNK Šibenik | 3:0 | ||||
| 18. Round | 27/02/2010 | HNK Šibenik | - | NK Zadar | 1:1 | ||||
| 19. Round | 06/03/2010 | Slaven Belupo | - | HNK Šibenik | 2:2 | ||||
| 20. Round | 13/03/2010 | HNK Šibenik | - | NK Inter Zaprešić | 0:0 | ||||
| 22. Round | 27/03/2010 | HNK Šibenik | - | Lokomotiva Zagreb | 0:0 | ||||
| 23. Round | 03/04/2010 | NK Varteks | - | HNK Šibenik | 5:1 | ||||
| 24. Round | 10/04/2010 | HNK Šibenik | - | NK Zagreb | 3:1 | ||||
| 25. Round | 14/04/2010 | HNK Cibalia | - | HNK Šibenik | 4:3 | ||||
| 26. Round | 17/04/2010 | HNK Šibenik | - | Hajduk Split | 0:1 | ||||
| 27. Round | 24/04/2010 | HNK Šibenik | - | NK Istra 1961 | 1:1 | ||||
| 28. Round | 01/05/2010 | NK Karlovac | - | HNK Šibenik | 0:2 | ||||
| 29. Round | 08/05/2010 | HNK Šibenik | - | Dinamo Zagreb | 2:1 |  |
Croatia
Australia