| 1. Round | 09/02/2013 | Sporting Cristal | - | Universidad San Martín | 1:0 |  |
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| 2. Round | 17/02/2013 | Universidad San Martín | - | Universitario de Deportes | 0:0 | |
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| 3. Round | 24/02/2013 | Unión Comercio | - | Universidad San Martín | 2:0 | |
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| 4. Round | 03/03/2013 | Universidad San Martín | - | José Gálvez | 3:5 | |
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| 5. Round | 09/03/2013 | Universidad Cesar Vallejo | - | Universidad San Martín | 1:0 | ||||
| 6. Round | 16/03/2013 | Pacífico FC | - | Universidad San Martín | 3:0 | ||||
| 8. Round | 07/04/2013 | Cienciano | - | Universidad San Martín | 2:0 | ||||
| 9. Round | 14/04/2013 | Universidad San Martín | - | Juan Aurich | 2:2 | ||||
| 10. Round | 21/04/2013 | Alianza Lima | - | Universidad San Martín | 2:3 | ||||
| 18. Round | 01/06/2013 | Universidad San Martín | - | Unión Comercio | 3:1 | |
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| 21. Round | 24/06/2013 | Universidad San Martín | - | Pacífico FC | 3:1 | ||||
| 24. Round | 11/07/2013 | Juan Aurich | - | Universidad San Martín | 0:1 | ||||
| 29. Round | 18/08/2013 | Universidad San Martín | - | FBC Melgar | 1:1 | ||||
| 30. Round | 25/08/2013 | Real Garcilaso | - | Universidad San Martín | 1:0 |
Argentina