| 21. Round | 11/01/2006 | Havre AC | - | Stade Brestois 29 | 2:0 | ||||
| 22. Round | 16/01/2006 | Stade Brestois 29 | - | SC Bastia | 0:2 | ||||
| 23. Round | 20/01/2006 | LB Châteauroux | - | Stade Brestois 29 | 0:0 | ||||
| 24. Round | 03/02/2006 | Clermont Foot Auvergne | - | Stade Brestois 29 | 0:1 | ||||
| 25. Round | 10/02/2006 | Stade Brestois 29 | - | US Créteil-Lusitanos | 0:2 | ||||
| 26. Round | 17/02/2006 | Amiens SC | - | Stade Brestois 29 | 1:1 |  |
|||
| 27. Round | 24/02/2006 | Stade Brestois 29 | - | Valenciennes FC | 1:1 | |
|||
| 28. Round | 03/03/2006 | Stade de Reims | - | Stade Brestois 29 | 1:0 | ||||
| 29. Round | 10/03/2006 | Stade Brestois 29 | - | Stade Lavallois | 2:2 | ||||
| 30. Round | 17/03/2006 | EA Guingamp | - | Stade Brestois 29 | 1:0 | ||||
| 31. Round | 11/04/2006 | Stade Brestois 29 | - | FC Sète | 1:1 | ||||
| 35. Round | 21/04/2006 | Stade Brestois 29 | - | Dijon FCO | 0:4 | ||||
| 36. Round | 28/04/2006 | Grenoble Foot 38 | - | Stade Brestois 29 | 1:1 | ||||
| 37. Round | 05/05/2006 | Stade Brestois 29 | - | SM Caen | 2:1 | ||||
| 38. Round | 12/05/2006 | FC Gueugnon | - | Stade Brestois 29 | 0:1 | |
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