| 10. Round | 16/10/2016 | PFC Beroe | - | Botev Plovdiv | 3:4 | ||||
| 11. Round | 22/10/2016 | Levski Sofia | - | PFC Beroe | 2:0 |  |
|||
| 12. Round | 29/10/2016 | PFC Beroe | - | PFC Montana | 2:1 | ||||
| 13. Round | 02/11/2016 | Lokomotiv Plovdiv | - | PFC Beroe | 1:1 | ||||
| 14. Round | 19/11/2016 | PFC Ludogorets Razgrad | - | PFC Beroe | 1:0 | ||||
| 15. Round | 27/11/2016 | PFC Beroe | - | Slavia Sofia | 1:1 | ||||
| 17. Round | 04/12/2016 | PFC Beroe | - | Neftochimik Burgas | 2:0 | ||||
| 18. Round | 12/12/2016 | Pirin Blagoevgrad | - | PFC Beroe | 1:1 | ||||
| 20. Round | 17/02/2017 | FC Dunav Ruse | - | PFC Beroe | 0:4 | ||||
| 21. Round | 25/02/2017 | PFC Beroe | - | CSKA Sofia | 0:1 | ||||
| 22. Round | 02/03/2017 | Cherno More Varna | - | PFC Beroe | 1:0 | ||||
| 23. Round | 06/03/2017 | Botev Plovdiv | - | PFC Beroe | 2:0 | ||||
| 24. Round | 12/03/2017 | PFC Beroe | - | Levski Sofia | 1:0 | ||||
| 25. Round | 17/03/2017 | PFC Montana | - | PFC Beroe | 0:3 |  |
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| 26. Round | 01/04/2017 | PFC Beroe | - | Lokomotiv Plovdiv | 3:2 |
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