| 26. Round | 18/02/2017 | Granada CF B | - | Real Murcia | 1:1 | ||||
| 27. Round | 25/02/2017 | Real Murcia | - | Recreativo Huelva | 2:2 | ||||
| 28. Round | 05/03/2017 | San Fernando CD | - | Real Murcia | 3:1 | ||||
| 30. Round | 19/03/2017 | FC Cartagena | - | Real Murcia | 1:3 | ||||
| 31. Round | 26/03/2017 | Real Murcia | - | Córdoba CF B | 2:0 | ||||
| 32. Round | 02/04/2017 | Marbella FC | - | Real Murcia | 1:1 | ||||
| 33. Round | 09/04/2017 | Real Murcia | - | Atlético Mancha Real | 3:1 |  |
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| 36. Round | 30/04/2017 | Atlético Sanluqueño CF | - | Real Murcia | 1:3 | ||||
| 38. Round | 14/05/2017 | Real Murcia | - | Extremadura UD | 3:0 |
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