| 3. Round | 16/08/2024 | Dinamo Zagreb | - | HNK Šibenik | 3:0 | ||||
| 4. Round | 23/08/2024 | Lokomotiva Zagreb | - | HNK Šibenik | 0:1 | ||||
| 11. Round | 25/10/2024 | Slaven Belupo | - | HNK Šibenik | 2:2 | ||||
| 13. Round | 08/11/2024 | HNK Šibenik | - | Lokomotiva Zagreb | 0:3 | ||||
| 14. Round | 24/11/2024 | HNK Šibenik | - | HNK Gorica | 1:0 |  |
|||
| 15. Round | 29/11/2024 | NK Varaždin | - | HNK Šibenik | 2:1 | ||||
| 16. Round | 08/12/2024 | HNK Šibenik | - | HNK Rijeka | 0:1 | ||||
| 17. Round | 14/12/2024 | NK Istra 1961 | - | HNK Šibenik | 3:3 | ||||
| 18. Round | 22/12/2024 | HNK Šibenik | - | Hajduk Split | 1:2 | ||||
| 19. Round | 24/01/2025 | NK Osijek | - | HNK Šibenik | 2:2 | ||||
| 20. Round | 01/02/2025 | HNK Šibenik | - | Slaven Belupo | 1:1 | ||||
| 21. Round | 07/02/2025 | Dinamo Zagreb | - | HNK Šibenik | 3:0 | ||||
| 35. Round | 16/05/2025 | NK Istra 1961 | - | HNK Šibenik | 3:0 |
Croatia