| 1. Round | 02/07/2016 | La Equidad | - | Envigado FC | 2:2 |  |
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| 2. Round | 09/07/2016 | Cortuluá | - | La Equidad | 2:0 | ||||
| 3. Round | 14/07/2016 | Deportivo Cali | - | La Equidad | 1:1 | ||||
| 4. Round | 17/07/2016 | La Equidad | - | Atlético Huila | 1:0 | |
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| 5. Round | 24/07/2016 | Independiente Medellín | - | La Equidad | 1:0 | ||||
| 8. Round | 14/08/2016 | La Equidad | - | Deportivo Pasto | 4:0 | ||||
| 9. Round | 20/08/2016 | Alianza Petrolera | - | La Equidad | 0:0 | ||||
| 10. Round | 27/08/2016 | La Equidad | - | Fortaleza FC | 2:2 | |
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| 7. Round | 03/09/2016 | Santa Fe | - | La Equidad | 1:1 | |
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| 11. Round | 11/09/2016 | La Equidad | - | Jaguares de Córdoba | 0:1 | |
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| 13. Round | 19/09/2016 | La Equidad | - | Deportes Tolima | 2:2 | ||||
| 14. Round | 24/09/2016 | Fortaleza FC | - | La Equidad | 1:1 | ||||
| 15. Round | 01/10/2016 | La Equidad | - | Atlético Nacional | 1:3 | ||||
| 16. Round | 18/10/2016 | Once Caldas | - | La Equidad | 0:2 | |
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| 17. Round | 22/10/2016 | La Equidad | - | Boyacá Chicó | 1:2 | |
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| 18. Round | 31/10/2016 | Millonarios | - | La Equidad | 1:2 | |
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| 19. Round | 05/11/2016 | La Equidad | - | Atlético Bucaramanga | 2:1 | |
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| 20. Round | 20/11/2016 | Atlético Junior | - | La Equidad | 2:1 |
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