| 1. Round | 13/07/2024 | Comerciantes Unidos | - | Cienciano | 1:2 |  |
|||
| 2. Round | 22/07/2024 | Cienciano | - | AD Tarma | 0:1 | ||||
| 3. Round | 27/07/2024 | Sporting Cristal | - | Cienciano | 5:1 | ||||
| 4. Round | 30/07/2024 | Sport Boys | - | Cienciano | 2:0 | ||||
| 5. Round | 04/08/2024 | Cienciano | - | Los Chankas | 0:0 |  |
|||
| 6. Round | 11/08/2024 | Mannucci | - | Cienciano | 1:2 | ||||
| 7. Round | 17/08/2024 | Cienciano | - | Atlético Grau | 1:0 | |
|||
| 8. Round | 21/08/2024 | Alianza Lima | - | Cienciano | 3:0 | ||||
| 9. Round | 26/08/2024 | Cienciano | - | FBC Melgar | 3:1 | |
|||
| 10. Round | 13/09/2024 | Universidad Técnica | - | Cienciano | 1:2 | |
|||
| 11. Round | 19/09/2024 | Cienciano | - | Sport Huancayo | 3:1 | |
|||
| 12. Round | 22/09/2024 | Deportivo Garcilaso | - | Cienciano | 1:0 | |
|||
| 13. Round | 28/09/2024 | Cienciano | - | Cusco FC | 1:2 | ||||
| 14. Round | 18/10/2024 | Universidad Cesar Vallejo | - | Cienciano | 2:2 | |
|||
| 15. Round | 23/10/2024 | Cienciano | - | Alianza Atlético | 3:0 | |
|||
| 16. Round | 27/10/2024 | Universitario de Deportes | - | Cienciano | 3:1 | ||||
| 17. Round | 31/10/2024 | Cienciano | - | Unión Comercio | 7:0 | |
Ecuador