| 1. Round | 02/07/2016 | Alianza Petrolera | - | Atlético Nacional | 3:3 |  |
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| 2. Round | 11/07/2016 | Once Caldas | - | Alianza Petrolera | 1:1 | ||||
| 4. Round | 18/07/2016 | Millonarios | - | Alianza Petrolera | 1:0 | ||||
| 5. Round | 23/07/2016 | Alianza Petrolera | - | Atlético Bucaramanga | 0:1 | ||||
| 6. Round | 30/07/2016 | Atlético Junior | - | Alianza Petrolera | 2:0 | ||||
| 7. Round | 07/08/2016 | Alianza Petrolera | - | Envigado FC | 1:0 | ||||
| 8. Round | 13/08/2016 | Cortuluá | - | Alianza Petrolera | 1:0 | |
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| 9. Round | 20/08/2016 | Alianza Petrolera | - | La Equidad | 0:0 | ||||
| 16. Round | 17/10/2016 | Alianza Petrolera | - | Deportivo Cali | 1:0 | ||||
| 17. Round | 22/10/2016 | Alianza Petrolera | - | Jaguares de Córdoba | 2:0 | ||||
| 18. Round | 29/10/2016 | Águilas Doradas | - | Alianza Petrolera | 0:1 | ||||
| 20. Round | 20/11/2016 | Fortaleza FC | - | Alianza Petrolera | 1:0 |
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