| 1. Round | 27/07/2008 | Sport Boys | - | Cienciano | 0:0 | ||||
| 2. Round | 30/07/2008 | Cienciano | - | José Gálvez | 2:1 |  |
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| 3. Round | 03/08/2008 | FBC Melgar | - | Cienciano | 1:0 |  |
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| 4. Round | 06/08/2008 | Cienciano | - | Universidad Cesar Vallejo | 2:1 | ||||
| 5. Round | 10/08/2008 | Cienciano | - | Universitario de Deportes | 2:1 | |
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| 6. Round | 13/08/2008 | Universidad San Martín | - | Cienciano | 1:1 | |
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| 7. Round | 17/08/2008 | Cienciano | - | Sporting Cristal | 2:1 | ||||
| 8. Round | 24/08/2008 | Juan Aurich | - | Cienciano | 1:0 | ||||
| 9. Round | 30/08/2008 | Atletico Minero | - | Cienciano | 1:1 | ||||
| 10. Round | 13/09/2008 | Cienciano | - | Sport Áncash | 0:1 | |
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| 11. Round | 18/09/2008 | Alianza Lima | - | Cienciano | 2:0 | ||||
| 12. Round | 21/09/2008 | Coronel Bolognesi | - | Cienciano | 2:0 | |
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| 14. Round | 06/10/2008 | Universidad Cesar Vallejo | - | Cienciano | 0:1 |  |
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