| 1. Round | 15/05/2016 | Alianza Atlético | - | Alianza Lima | 0:1 | ||||
| 2. Round | 19/05/2016 | Unión Comercio | - | Alianza Atlético | 2:2 | ||||
| 7. Round | 06/07/2016 | Alianza Atlético | - | Ayacucho FC | 2:0 | ||||
| 8. Round | 09/07/2016 | Juan Aurich | - | Alianza Atlético | 0:0 | ||||
| 9. Round | 16/07/2016 | Alianza Atlético | - | Universitario de Deportes | 2:3 | ||||
| 13. Round | 03/08/2016 | Alianza Atlético | - | Deportivo Municipal | 2:0 | ||||
| 14. Round | 08/08/2016 | Comerciantes Unidos | - | Alianza Atlético | 3:1 | ||||
| 15. Round | 14/08/2016 | Alianza Atlético | - | Real Garcilaso | 2:1 |
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