| 4. Round | 22/09/2024 | CDA Navalcarnero | - | Rayo Majadahonda | 0:0 | ||||
| 5. Round | 29/09/2024 | Rayo Majadahonda | - | Getafe CF B | 1:2 |  |
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| 6. Round | 06/10/2024 | CD Móstoles URJC | - | Rayo Majadahonda | 0:1 | |
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| 7. Round | 13/10/2024 | Rayo Majadahonda | - | CDC Moscardó | 1:2 | ||||
| 8. Round | 20/10/2024 | CD Atlético Paso | - | Rayo Majadahonda | 2:3 | ||||
| 9. Round | 27/10/2024 | Rayo Majadahonda | - | UD Melilla | 0:0 | |
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| 10. Round | 03/11/2024 | CD Guadalajara | - | Rayo Majadahonda | 3:0 | |
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| 11. Round | 10/11/2024 | Rayo Majadahonda | - | CF Talavera | 0:1 | ||||
| 13. Round | 24/11/2024 | Rayo Majadahonda | - | UD SS Reyes | 2:1 | ||||
| 14. Round | 01/12/2024 | Unión Adarve | - | Rayo Majadahonda | 1:0 | ||||
| 15. Round | 07/12/2024 | Rayo Majadahonda | - | Real Madrid C | 2:1 | ||||
| 16. Round | 15/12/2024 | CD Unión Sur Yaiza | - | Rayo Majadahonda | 1:1 | ||||
| 17. Round | 22/12/2024 | Rayo Majadahonda | - | CD Tenerife B | 2:0 |
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