| Group A | 19/08/2012 | Cienciano | - | Universitario de Deportes | 3:0 | ||||
| Group A | 26/08/2012 | Sport Huancayo | - | Cienciano | 2:0 | ||||
| Group A | 02/09/2012 | Cienciano | - | Cobresol FBC | 2:0 | ||||
| Group A | 16/09/2012 | Universidad San Martín | - | Cienciano | 1:0 | ||||
| Group A | 22/09/2012 | Cienciano | - | Inti Gas | 0:0 | ||||
| Group A | 27/10/2012 | Cienciano | - | Sport Huancayo | 1:1 | ||||
| Group A | 01/11/2012 | Cobresol FBC | - | Cienciano | 1:2 | ||||
| Group A | 04/11/2012 | Cienciano | - | Universidad San Martín | 2:2 | ||||
| Group A | 07/11/2012 | Cienciano | - | Sporting Cristal | 1:2 | ||||
| Group A | 10/11/2012 | Inti Gas | - | Cienciano | 0:1 | ||||
| Group A | 18/11/2012 | Cienciano | - | José Gálvez | 2:0 |  |
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| Group A | 25/11/2012 | Sporting Cristal | - | Cienciano | 3:3 | |
Peru