| 1. Round | 04/02/2013 | Deportes Tolima | - | Independiente Medellín | 1:0 | ||||
| 2. Round | 10/02/2013 | Independiente Medellín | - | Millonarios | 0:0 |  |
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| 3. Round | 17/02/2013 | La Equidad | - | Independiente Medellín | 1:0 | ||||
| 4. Round | 24/02/2013 | Alianza Petrolera | - | Independiente Medellín | 0:1 | ||||
| 5. Round | 03/03/2013 | Independiente Medellín | - | Envigado FC | 0:1 | ||||
| 6. Round | 11/03/2013 | Once Caldas | - | Independiente Medellín | 2:1 | ||||
| 7. Round | 17/03/2013 | Independiente Medellín | - | Boyacá Chicó | 3:1 | ||||
| 8. Round | 30/03/2013 | Deportivo Pasto | - | Independiente Medellín | 1:0 | ||||
| 9. Round | 07/04/2013 | Independiente Medellín | - | Atlético Nacional | 0:0 | ||||
| 10. Round | 14/04/2013 | Independiente Medellín | - | Cúcuta Deportivo | 1:1 |  |
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| 12. Round | 21/04/2013 | Independiente Medellín | - | Santa Fe | 2:2 | ||||
| 13. Round | 28/04/2013 | Atlético Nacional | - | Independiente Medellín | 2:2 | ||||
| 14. Round | 04/05/2013 | Independiente Medellín | - | Itagüi Ditaires | 1:0 | ||||
| 15. Round | 11/05/2013 | Deportes Quindío | - | Independiente Medellín | 0:2 |
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