| 1. Round | 25/08/2019 | CD Alavés B | - | UD Logroñés | 1:1 | ||||
| 4. Round | 14/09/2019 | CD Guijuelo | - | CD Alavés B | 1:0 | ||||
| 6. Round | 28/09/2019 | SD Leioa | - | CD Alavés B | 2:0 | ||||
| 7. Round | 05/10/2019 | CD Alavés B | - | Barakaldo CF | 1:0 | ||||
| 10. Round | 27/10/2019 | CD Alavés B | - | Haro Deportivo | 2:0 |  |
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| 11. Round | 03/11/2019 | CD Calahorra | - | CD Alavés B | 1:1 |  |
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| 13. Round | 17/11/2019 | Salamanca CF UDS | - | CD Alavés B | 1:0 | |
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| 14. Round | 24/11/2019 | CD Alavés B | - | CD Tudelano | 1:0 | ||||
| 15. Round | 30/11/2019 | CA Osasuna B | - | CD Alavés B | 3:1 | ||||
| 20. Round | 15/01/2020 | UD Logroñés | - | CD Alavés B | 0:0 | |
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| 21. Round | 19/01/2020 | CD Alavés B | - | Burgos CF | 2:2 | ||||
| 22. Round | 26/01/2020 | Unionistas CF | - | CD Alavés B | 4:2 |
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