| 1. Round | 31/01/2016 | Atlético Junior | - | Atlético Huila | 1:0 | ||||
| 2. Round | 06/02/2016 | Independiente Medellín | - | Atlético Junior | 0:1 | ||||
| 10. Round | 19/03/2016 | Jaguares de Córdoba | - | Atlético Junior | 0:2 | ||||
| 4. Round | 24/03/2016 | Santa Fe | - | Atlético Junior | 3:2 | ||||
| 17. Round | 08/05/2016 | Atlético Junior | - | Deportivo Cali | 2:0 | ||||
| 20. Round | 29/05/2016 | La Equidad | - | Atlético Junior | 0:0 |
Colombia