| 1. Round | 12/07/2009 | Boyacá Chicó | - | Atlético Huila | 2:3 |  |
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| 2. Round | 19/07/2009 | Atlético Huila | - | Deportes Tolima | 1:0 | |
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| 3. Round | 26/07/2009 | Atlético Huila | - | Santa Fe | 2:1 | |
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| 5. Round | 09/08/2009 | Atlético Huila | - | Envigado FC | 3:2 | ||||
| 6. Round | 16/08/2009 | Cúcuta Deportivo | - | Atlético Huila | 1:2 | |
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| 7. Round | 24/08/2009 | Atlético Huila | - | Independiente Medellín | 0:2 | ||||
| 8. Round | 30/08/2009 | Atlético Nacional | - | Atlético Huila | 1:1 | ||||
| 9. Round | 12/09/2009 | Deportes Tolima | - | Atlético Huila | 1:0 | ||||
| 10. Round | 19/09/2009 | Atlético Huila | - | Deportivo Pereira | 2:1 | ||||
| 11. Round | 28/09/2009 | Once Caldas | - | Atlético Huila | 2:1 | ||||
| 13. Round | 17/10/2009 | Deportivo Pasto | - | Atlético Huila | 1:1 | |
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| 14. Round | 22/10/2009 | Atlético Huila | - | América de Cali | 2:2 | ||||
| 16. Round | 01/11/2009 | Atlético Huila | - | Atlético Junior | 2:1 |
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