| 23. Round | 07/02/2021 | Bayern München II | - | KFC Uerdingen 05 | 0:1 | ||||
| 14. Round | 10/02/2021 | Bayern München II | - | FSV Zwickau | 3:2 | ||||
| 24. Round | 13/02/2021 | 1. FC Kaiserslautern | - | Bayern München II | 1:1 |  |
|||
| 25. Round | 21/02/2021 | Bayern München II | - | Viktoria Köln | 0:1 | ||||
| 22. Round | 24/02/2021 | Dynamo Dresden | - | Bayern München II | 1:1 | ||||
| 26. Round | 01/03/2021 | Waldhof Mannheim | - | Bayern München II | 2:2 |  |
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| 27. Round | 07/03/2021 | Bayern München II | - | SV Wehen Wiesbaden | 2:0 | ||||
| 21. Round | 10/03/2021 | Bayern München II | - | SC Verl | 1:2 | ||||
| 28. Round | 13/03/2021 | Bayern München II | - | 1. FC Magdeburg | 0:2 | |
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| 30. Round | 03/04/2021 | Bayern München II | - | VfB Lübeck | 2:3 | ||||
| 33. Round | 20/04/2021 | FSV Zwickau | - | Bayern München II | 1:1 | ||||
| 34. Round | 26/04/2021 | Bayern München II | - | 1. FC Saarbrücken | 0:4 |
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