| 1. Round | 02/03/2025 | FK Panevėžys | - | FA Šiauliai | 1:3 | ||||
| 4. Round | 29/03/2025 | FA Šiauliai | - | Kauno Žalgiris | 2:3 | ||||
| 9. Round | 26/04/2025 | FC Džiugas | - | FA Šiauliai | 0:1 | ||||
| 10. Round | 02/05/2025 | FA Šiauliai | - | FC Hegelmann | 0:3 | ||||
| 11. Round | 11/05/2025 | DFK Dainava | - | FA Šiauliai | 1:2 |
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