| 11. Round | 23/10/2009 | FC Istres | - | AC Ajaccio | 0:2 | ||||
| 12. Round | 27/10/2009 | Clermont Foot Auvergne 63 | - | FC Istres | 2:0 | ||||
| 13. Round | 30/10/2009 | FC Istres | - | CS Sedan | 3:1 | ||||
| 14. Round | 06/11/2009 | RC Strasbourg | - | FC Istres | 2:0 | ||||
| 15. Round | 27/11/2009 | FC Istres | - | Vannes OC | 1:1 | ||||
| 16. Round | 01/12/2009 | Stade Brestois 29 | - | FC Istres | 1:0 | ||||
| 17. Round | 04/12/2009 | FC Istres | - | SM Caen | 2:1 | ||||
| 19. Round | 22/12/2009 | Nîmes Olympique | - | FC Istres | 2:1 | ||||
| 21. Round | 19/01/2010 | EA Guingamp | - | FC Istres | 0:0 | ||||
| 35. Round | 30/04/2010 | SM Caen | - | FC Istres | 1:1 | ||||
| 38. Round | 14/05/2010 | SC Bastia | - | FC Istres | 2:0 |
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