| 1. Round | 30/01/2016 | Boyacá Chicó | - | Santa Fe | 0:1 |  |
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| 2. Round | 07/02/2016 | Deportivo Pasto | - | Boyacá Chicó | 2:0 | |
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| 3. Round | 14/02/2016 | Boyacá Chicó | - | Alianza Petrolera | 1:1 |  |
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| 4. Round | 17/02/2016 | Jaguares de Córdoba | - | Boyacá Chicó | 1:1 | ||||
| 5. Round | 21/02/2016 | Boyacá Chicó | - | Águilas Doradas | 0:2 | ||||
| 6. Round | 25/02/2016 | Deportes Tolima | - | Boyacá Chicó | 2:1 | ||||
| 7. Round | 27/02/2016 | Boyacá Chicó | - | Fortaleza FC | 1:0 | |
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| 8. Round | 05/03/2016 | Atlético Nacional | - | Boyacá Chicó | 2:0 | ||||
| 9. Round | 13/03/2016 | Once Caldas | - | Boyacá Chicó | 0:0 | ||||
| 10. Round | 21/03/2016 | Boyacá Chicó | - | Patriotas FC | 1:0 | |
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| 13. Round | 16/04/2016 | Boyacá Chicó | - | Atlético Bucaramanga | 1:1 | ||||
| 14. Round | 23/04/2016 | Atlético Junior | - | Boyacá Chicó | 1:1 | ||||
| 15. Round | 27/04/2016 | Boyacá Chicó | - | Envigado FC | 1:1 | |
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| 16. Round | 01/05/2016 | Cortuluá | - | Boyacá Chicó | 2:2 | ||||
| 17. Round | 08/05/2016 | Boyacá Chicó | - | La Equidad | 3:4 | |
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| 18. Round | 14/05/2016 | Atlético Huila | - | Boyacá Chicó | 3:1 | |
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| 19. Round | 22/05/2016 | Boyacá Chicó | - | Independiente Medellín | 1:1 | |
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| 20. Round | 29/05/2016 | Patriotas FC | - | Boyacá Chicó | 1:0 |
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