| 1. Round | 21/01/2024 | Atlético Junior | - | Atlético Bucaramanga | 2:0 | ||||
| 2. Round | 28/01/2024 | Boyacá Chicó | - | Atlético Junior | 2:2 |  |
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| 3. Round | 02/02/2024 | Atlético Junior | - | Independiente Medellín | 3:0 | ||||
| 5. Round | 08/02/2024 | Atlético Junior | - | Deportivo Pasto | 2:0 | ||||
| 6. Round | 11/02/2024 | Fortaleza FC | - | Atlético Junior | 2:0 | |
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| 9. Round | 26/02/2024 | Deportivo Pereira | - | Atlético Junior | 3:3 | |
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| 11. Round | 08/03/2024 | Águilas Doradas | - | Atlético Junior | 0:2 | ||||
| 12. Round | 16/03/2024 | Atlético Junior | - | Jaguares de Córdoba | 3:1 | ||||
| 13. Round | 22/03/2024 | Patriotas FC | - | Atlético Junior | 1:0 | ||||
| 14. Round | 30/03/2024 | Atlético Junior | - | La Equidad | 1:0 | ||||
| 15. Round | 07/04/2024 | América de Cali | - | Atlético Junior | 4:1 | ||||
| 16. Round | 14/04/2024 | Atlético Junior | - | Envigado FC | 1:1 | ||||
| 17. Round | 18/04/2024 | Millonarios | - | Atlético Junior | 3:2 | ||||
| 18. Round | 21/04/2024 | Atlético Junior | - | Once Caldas | 1:0 | ||||
| 19. Round | 28/04/2024 | Deportivo Cali | - | Atlético Junior | 0:0 |
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