| 4. Round | 19/09/2016 | Asteras Tripolis | - | PAOK Saloniki | 1:2 |  |
|||
| 5. Round | 25/09/2016 | PAOK Saloniki | - | Xanthi FC | 0:0 | ||||
| 6. Round | 02/10/2016 | Veria FC | - | PAOK Saloniki | 0:0 | ||||
| 10. Round | 06/11/2016 | Panionios GSS | - | PAOK Saloniki | 1:0 | ||||
| 12. Round | 28/11/2016 | PAOK Saloniki | - | Atromitos | 3:4 | |
|||
| 13. Round | 04/12/2016 | Panathinaikos | - | PAOK Saloniki | 1:0 | ||||
| 14. Round | 11/12/2016 | PAOK Saloniki | - | Platanias Chanion | 3:0 | ||||
| 1. Round | 03/01/2017 | Levadiakos | - | PAOK Saloniki | 0:1 | ||||
| 2. Round | 08/01/2017 | PAOK Saloniki | - | PAS Giannina | 0:1 | ||||
| 17. Round | 23/01/2017 | PAS Giannina | - | PAOK Saloniki | 0:1 | ||||
| 11. Round | 01/02/2017 | AE Lárissa | - | PAOK Saloniki | 0:2 | ||||
| 19. Round | 05/02/2017 | PAOK Saloniki | - | Asteras Tripolis | 3:2 | ||||
| 25. Round | 19/03/2017 | PAOK Saloniki | - | Panionios GSS | 1:0 | ||||
| 26. Round | 02/04/2017 | PAOK Saloniki | - | AE Lárissa | 2:0 | ||||
| 27. Round | 05/04/2017 | Atromitos | - | PAOK Saloniki | 0:2 | |
|||
| 30. Round | 30/04/2017 | PAOK Saloniki | - | AO Kerkyra | 5:1 | |
Greece