| 25. Round | 08/03/2017 | FK Neftekhimik | - | Zenit St. Petersburg 2 | 1:0 | ||||
| 26. Round | 12/03/2017 | Mordovia Saransk | - | FK Neftekhimik | 1:0 | ||||
| 27. Round | 19/03/2017 | FK Neftekhimik | - | Volgar Astrakhan | 2:0 |  |
|||
| 28. Round | 26/03/2017 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | FK Neftekhimik | 1:0 | ||||
| 29. Round | 01/04/2017 | FK Neftekhimik | - | Spartak Nalchik | 0:1 | ||||
| 30. Round | 08/04/2017 | Fakel Voronezh | - | FK Neftekhimik | 3:2 | ||||
| 35. Round | 06/05/2017 | FK Neftekhimik | - | FK Tosno | 0:2 |  |
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| 36. Round | 10/05/2017 | FK Tyumen | - | FK Neftekhimik | 2:0 | |
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| 37. Round | 14/05/2017 | FK Neftekhimik | - | FK Tambov | 1:1 | ||||
| 38. Round | 20/05/2017 | FK Neftekhimik | - | Enisey Krasnoyarsk | 0:2 |
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