| 1. Round | 21/08/2016 | RCD Mallorca B | - | CD Alcoyano | 0:1 | ||||
| 2. Round | 27/08/2016 | Atlético Baleares | - | RCD Mallorca B | 2:1 |  |
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| 4. Round | 11/09/2016 | RCD Mallorca B | - | UE Cornellà | 0:3 | ||||
| 7. Round | 01/10/2016 | CE Sabadell | - | RCD Mallorca B | 1:1 | ||||
| 10. Round | 23/10/2016 | RCD Mallorca B | - | CD Eldense | 0:1 | ||||
| 14. Round | 13/11/2016 | RCD Mallorca B | - | AE Prat | 0:0 | ||||
| 18. Round | 11/12/2016 | RCD Mallorca B | - | Hércules CF | 0:2 | ||||
| 19. Round | 18/12/2016 | Villarreal CF B | - | RCD Mallorca B | 3:2 | ||||
| 20. Round | 08/01/2017 | CD Alcoyano | - | RCD Mallorca B | 1:0 |
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