| 1. Round | 15/03/2004 | Lokomotiv Moskva | - | Shinnik Yaroslavl | 3:0 | ||||
| 12. Round | 19/05/2004 | CSKA Moskva | - | Shinnik Yaroslavl | 1:1 | ||||
| 17. Round | 07/08/2004 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Moskva | 1:1 | ||||
| 19. Round | 14/08/2004 | Shinnik Yaroslavl | - | CSKA Moskva | 2:1 | ||||
| 20. Round | 21/08/2004 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Amkar Perm | 2:1 | ||||
| 22. Round | 12/09/2004 | Rubin Kazan | - | Shinnik Yaroslavl | 0:1 | ||||
| 23. Round | 18/09/2004 | Krylia Sovetov | - | Shinnik Yaroslavl | 1:2 | ||||
| 24. Round | 25/09/2004 | Shinnik Yaroslavl | - | Zenit St. Petersburg | 2:1 | ||||
| 25. Round | 03/10/2004 | Dinamo Moskva | - | Shinnik Yaroslavl | 1:0 | ||||
| 26. Round | 17/10/2004 | Shinnik Yaroslavl | - | Spartak Moskva | 1:1 | ||||
| 27. Round | 24/10/2004 | Alania Vladikavkaz | - | Shinnik Yaroslavl | 2:1 | ||||
| 28. Round | 30/10/2004 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Rostov | 1:0 | ||||
| 29. Round | 08/11/2004 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | Shinnik Yaroslavl | 1:0 | ||||
| 30. Round | 12/11/2004 | Shinnik Yaroslavl | - | Lokomotiv Moskva | 0:2 |
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