| 2. Round | 06/08/2012 | Atlético Nacional | - | Itagüi Ditaires | 1:1 | ||||
| 3. Round | 12/08/2012 | Boyacá Chicó | - | Atlético Nacional | 1:1 | ||||
| 4. Round | 19/08/2012 | Atlético Nacional | - | Millonarios | 0:0 | ||||
| 5. Round | 25/08/2012 | Deportes Tolima | - | Atlético Nacional | 1:3 |  |
|||
| 6. Round | 30/08/2012 | Atlético Nacional | - | Cúcuta Deportivo | 1:1 | ||||
| 7. Round | 02/09/2012 | Independiente Medellín | - | Atlético Nacional | 0:3 | ||||
| 8. Round | 16/09/2012 | Atlético Nacional | - | Deportes Quindío | 1:1 | ||||
| 9. Round | 23/09/2012 | Atlético Nacional | - | Independiente Medellín | 2:2 | ||||
| 10. Round | 28/09/2012 | Deportivo Pasto | - | Atlético Nacional | 0:2 | |
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| 11. Round | 30/09/2012 | Atlético Nacional | - | Envigado FC | 1:0 | ||||
| 14. Round | 13/10/2012 | Atlético Huila | - | Atlético Nacional | 0:0 | ||||
| 15. Round | 21/10/2012 | Atlético Nacional | - | La Equidad | 0:0 |  |
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| 16. Round | 28/10/2012 | Atlético Junior | - | Atlético Nacional | 1:0 | ||||
| 17. Round | 03/11/2012 | Once Caldas | - | Atlético Nacional | 0:2 |
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