| 1. Round | 20/08/2016 | AD Alcorcón | - | SD Huesca | 0:0 | ||||
| 2. Round | 28/08/2016 | SD Huesca | - | Gimnàstic de Tarragona | 1:1 | ||||
| 3. Round | 04/09/2016 | Real Zaragoza | - | SD Huesca | 1:0 |  |
|||
| 7. Round | 24/09/2016 | Real Valladolid | - | SD Huesca | 1:2 | ||||
| 8. Round | 01/10/2016 | SD Huesca | - | UD Almería | 2:0 | ||||
| 9. Round | 09/10/2016 | RCD Mallorca | - | SD Huesca | 3:0 | ||||
| 11. Round | 22/10/2016 | Getafe CF | - | SD Huesca | 1:1 | ||||
| 12. Round | 29/10/2016 | SD Huesca | - | CF Reus Deportiu | 2:1 | ||||
| 13. Round | 05/11/2016 | Cádiz CF | - | SD Huesca | 1:0 |  |
|||
| 14. Round | 12/11/2016 | SD Huesca | - | Real Oviedo | 4:0 | ||||
| 15. Round | 20/11/2016 | Rayo Vallecano | - | SD Huesca | 2:2 | ||||
| 16. Round | 27/11/2016 | SD Huesca | - | Girona FC | 1:2 | ||||
| 18. Round | 10/12/2016 | SD Huesca | - | UCAM Murcia CF | 5:2 | ||||
| 31. Round | 26/03/2017 | CD Mirandés | - | SD Huesca | 1:3 | ||||
| 36. Round | 01/05/2017 | SD Huesca | - | Rayo Vallecano | 2:0 | ||||
| 39. Round | 20/05/2017 | UCAM Murcia CF | - | SD Huesca | 3:1 |
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