| 1. Round | 13/07/2009 | Millonarios | - | Atlético Junior | 3:1 |  |
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| 2. Round | 19/07/2009 | Deportes Quindío | - | Millonarios | 1:1 | ||||
| 3. Round | 27/07/2009 | Millonarios | - | Deportes Tolima | 0:2 | |
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| 4. Round | 02/08/2009 | Millonarios | - | Atlético Huila | 1:1 | |
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| 5. Round | 08/08/2009 | Cúcuta Deportivo | - | Millonarios | 0:1 | |
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| 6. Round | 16/08/2009 | Millonarios | - | Atlético Nacional | 1:1 | ||||
| 9. Round | 13/09/2009 | Santa Fe | - | Millonarios | 4:2 | |
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| 12. Round | 03/10/2009 | Boyacá Chicó | - | Millonarios | 2:2 |  |
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| 13. Round | 18/10/2009 | Millonarios | - | Santa Fe | 1:1 | |
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| 16. Round | 01/11/2009 | Deportivo Pereira | - | Millonarios | 1:0 | ||||
| 17. Round | 08/11/2009 | Millonarios | - | La Equidad | 2:0 | ||||
| 18. Round | 15/11/2009 | América de Cali | - | Millonarios | 1:1 |
Colombia