| 2. Round | 10/07/2016 | Atlético Nacional | - | Jaguares de Córdoba | 2:1 | ||||
| 4. Round | 17/07/2016 | Atlético Nacional | - | Deportes Tolima | 2:2 | ||||
| 6. Round | 31/07/2016 | Deportivo Cali | - | Atlético Nacional | 1:0 | ||||
| 8. Round | 15/08/2016 | Boyacá Chicó | - | Atlético Nacional | 1:1 | ||||
| 11. Round | 10/09/2016 | Atlético Bucaramanga | - | Atlético Nacional | 2:2 | ||||
| 13. Round | 18/09/2016 | Envigado FC | - | Atlético Nacional | 0:0 |  |
|||
| 14. Round | 24/09/2016 | Atlético Nacional | - | Cortuluá | 1:1 | ||||
| 3. Round | 09/10/2016 | Águilas Doradas | - | Atlético Nacional | 1:1 | ||||
| 16. Round | 16/10/2016 | Atlético Nacional | - | Atlético Huila | 4:0 | |
|||
| 18. Round | 30/10/2016 | Atlético Nacional | - | Patriotas FC | 2:1 | ||||
| 20. Round | 20/11/2016 | Atlético Nacional | - | Deportivo Pasto | 3:1 |
Colombia