| 3. Round | 13/09/2015 | Real Garcilaso | - | Cienciano | 1:1 | ||||
| 4. Round | 16/09/2015 | Cienciano | - | Sport Loreto | 1:0 |  |
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| 6. Round | 27/09/2015 | Cienciano | - | Sporting Cristal | 2:2 | ||||
| 7. Round | 30/09/2015 | Unión Comercio | - | Cienciano | 3:1 | ||||
| 8. Round | 04/10/2015 | Cienciano | - | Alianza Atlético | 2:0 | ||||
| 9. Round | 16/10/2015 | Universidad Técnica | - | Cienciano | 0:0 | ||||
| 12. Round | 28/10/2015 | FBC Melgar | - | Cienciano | 5:1 | ||||
| 13. Round | 01/11/2015 | Cienciano | - | Alianza Lima | 1:0 | ||||
| 14. Round | 03/11/2015 | Deportivo Municipal | - | Cienciano | 1:0 | ||||
| 10. Round | 15/11/2015 | Cienciano | - | Ayacucho FC | 1:1 | |
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| 16. Round | 22/11/2015 | Juan Aurich | - | Cienciano | 2:2 | ||||
| 17. Round | 29/11/2015 | Cienciano | - | Universidad San Martín | 3:0 |
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