| 2. Round | 02/02/2025 | La Equidad | - | Atlético Nacional | 0:1 | ||||
| 3. Round | 10/02/2025 | Atlético Nacional | - | Deportivo Pereira | 3:0 | ||||
| 4. Round | 13/02/2025 | Santa Fe | - | Atlético Nacional | 2:2 | ||||
| 6. Round | 23/02/2025 | Alianza FC | - | Atlético Nacional | 3:2 | ||||
| 5. Round | 20/03/2025 | Atlético Nacional | - | Deportes Tolima | 4:3 | ||||
| 10. Round | 23/03/2025 | Atlético Nacional | - | Independiente Medellín | 1:1 | ||||
| 14. Round | 17/04/2025 | Atlético Nacional | - | Boyacá Chicó | 4:1 | ||||
| 17. Round | 04/05/2025 | Independiente Medellín | - | Atlético Nacional | 1:1 |  |
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